Les fragments conservés du mécanisme d’Anticythère contiennent 30 engrenages. La plupart d’entre eux, soit 27, se trouvent dans le fragment A. Les fragments B, C et D contiennent chacun un engrenage.
Ces engrenages ne suffisent toutefois pas à assurer toutes les fonctions connues du Mécanisme : au moins cinq engrenages supplémentaires sont nécessaires. Cette reconstruction laisse par ailleurs inutilisée une roue du fragment D, qui pourrait appartenir à un système épicyclique aujourd’hui disparu, associé au modèle solaire d’Hipparque ou aux mécanismes planétaires.
Le nombre total d’engrenages dépend donc du nombre de planètes représentées et du degré de précision avec lequel leurs mouvements étaient reproduits.