Το Πρόγραμμα Έρευνας για τον Μηχανισμό των Αντικυθήρων στηρίχθηκε αρχικά από το Leverhulme Trust, υπό την αιγίδα του Υπουργείου Πολιτισμού και του Εθνικού Αρχαιολογικού Μουσείου.
Το Πρόγραμμα ευεργετήθηκε εν συνεχεία από:
Η έρευνα του Γιάννη Μπιτσάκη πραγματοποιήθηκε στο πλαίσιο της διδακτορικής του διατριβής με θέμα: "Εκπαιδευτικές προεκτάσεις της ιστορίας του Μηχανισμού των Αντικυθήρων", που εκπονείται στο Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Η έρευνα έχει συγχρηματοδοτηθεί από την Ευρωπαϊκή Ένωση (Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο - ΕΚΤ) και από εθνικούς πόρους μέσω του Επιχειρησιακού Προγράμματος «Εκπαίδευση και Δια Βίου Μάθηση» του Εθνικού Στρατηγικού Πλαισίου Αναφοράς (ΕΣΠΑ) – Ερευνητικό Χρηματοδοτούμενο Έργο: Ηράκλειτος ΙΙ.
Το Διεθνές Συνέδριο του Νοεμβρίου/Δεκεμβρίου 2006 διοργανώθηκε από το Πρόγραμμα Έρευνας για τον Μηχανισμό των Αντικυθήρων και το Μορφωτικό Ίδρυμα Εθνικής Τραπέζης. Η πραγματοποίησή του δεν θα ήταν δυνατή χωρίς τη στήριξη της Εθνικής Τράπεζας.